дикий вопрос бухгалтерам

конечно. Налоговые органы не имеют права отказать организации в приеме чего-либо. Тем более, что штрих-код не является обязательным реквизитом декларации. Если залупят..ся, скандальте, упоминая вышеперечисленные аргументы, и требуйте начальника. Если неохота скандалить прилюдно, то отправляйте по почте заказнм письмом с описью вложения, а на сайте налог.ру состряпайте жалобку с указанием фамилии сотрудника ИФНС, отказавшегося принять декларацию.